基因突變是一種普遍存在的生物界現象，它的特點可有以下幾種：
1. 基因突變的有害性和有利性
大多數基因的突變，對生物的生長與發育往往是有害的。可能會導致基因原有功能喪失；基因間及相關代謝過程的協調關系被破壞；性狀變異、個體發育異常，生存競爭與生殖能力下降，甚至死亡――致死突變。突變的有害和有利性是相對的，在某些情況下，基因突變的有害與與有利性可以轉化。如抗逆性突變是有利的，又如作物矮桿突變型在多風與高肥環境下是有利的。
2.基因突變的普遍性和稀有性
基因突變在生物界具有普遍性，無論是低等生物還是高等生物，都有可能發生基因突變。包括自然突變和人工誘變突變。但是在自然狀態下，突變也是極為稀有的，野生型基因以極低的突變率發生突變。
3. 基因突變的隨機性和不定向性
（1）基因突變的隨機性
①部位上的隨機。基因突變既可以發生在體細胞中，也可以發生在生殖細胞中，且前者一般不會傳遞給后代，而后者可通過生殖細胞傳遞給子代。此外基因突變既可以發生在同一DNA分子的不同部分，也可以發生在細胞內不同的DNA分子上。
②時間上的隨機，基因突變可以發生在生物個體發育的任何階段，甚至在趨于衰老的個體中也容易發生，如老年人易得皮膚癌等。
（2）基因突變的不定向性
基因突變的不定向性指基因突變可以多方向發生，即基因內部多個突變部位分別改變后會產生多種等位基因形式。
4.基因突變的重復性和可逆性
（1）基因突變的重復性是指已經發生突變的基因，在某種條件下，還可能再次獨立地發生突變而形成其另外一種新的等位基因形式。也就是說，任何一個基因位點的突變可能會以一定的頻率反復發生。
（2）基因突變的可逆性，基因突變的發生方向是可逆的。
5.基因突變的平行性
指親緣關系相近的物種因為遺傳基礎比較接近，往往會發生相似的基因突變。
