（1）各種疾病引起的神經衰弱癥候群，各種腦器質性疾病，如腦動脈硬化、顱內腫瘤、顱內感染、顱腦外傷后各種急、慢性工業中毒，各種慢性軀體疾病，如肺結核、潰瘍病、慢性肝炎、鼻竇炎、屈光不正、甲狀腺及腎上腺疾病、高血壓等，均可有類似神經衰弱的癥狀表現。應該根據這些疾病的不同病因、常見癥狀、病程特點、陽性體征、輔助檢查加以鑒別。
（2）某些重性精神病，如精神分裂癥和抑郁癥等重性精神病的早期、病程中和緩解期均可出現類似神經衰弱的定狀。但這類患者往往不能主動關心自己的健康，不積極求治，缺乏自制力，并有相應的精神病性癥狀，存在各自精神病的特點。
（3）其他類型的神經癥，神經衰弱的癥狀也常見于焦慮癥、抑郁性神經癥、軀體化障礙、疑病癥等神經癥。如果患者有焦慮癥狀、抑郁癥狀、身體不適、疑病癥狀，并以這些癥狀為主要臨床相則不再診斷為神經衰弱，而診斷各自相應的神經癥。
（4）疲勞狀態，較長時間工作以后可以出現疲勞狀態，應與神經衰弱鑒別，疲勞是由于腦力或體力過度勞累，缺乏休息而產生的，在造成疲勞的因素消除以后經過充分休息癥狀即可較快消失。
（5）腦外傷所致的神經衰弱癥候群，主要表現也類似于神經衰弱，但本病具有頭顱外傷病史或有顱腦X線的特殊檢查所見。
