患者可發生聽力減退、耳鳴或耳部飽滿感。少數患者亦可發生眩暈、步履不穩等癥狀，聽力減退一般于停藥后癥狀不再加重。但個別在停藥后可能繼續發展至耳聾。阿米卡星有一定腎毒性患者可出現血尿、排尿次數減少或尿量減少，血尿素氮、血肌酐值增高等，大多系可逆性。停藥后即見減輕，但亦有個別報道出現腎功能衰竭，在用藥過程中應注意尿常規和腎功能測定，以防止出現嚴重腎毒性反應。注意聽力檢查或聽電圖檢查，尤其注意高頻聽力損害，這對老年患者尤為重要。療程中有條件時應監測血藥濃度尤其新生兒、老年和腎功能減退患者。
下列情況應慎用阿米卡星。一、失水。可使血藥濃度增高易產生毒性反應。二、第8對腦神經損害，因阿米卡星可導致前庭神經和聽神經損害。三、重癥肌無力或帕金森病。因本病可引起神經肌肉阻滯作用導致骨骼肌軟弱。四、腎功能損害者。因阿米卡星具有腎毒性阿米卡星可使丙氨酸氨基轉移酶、門冬氨酸氨基轉移酶、血清膽紅素濃度及乳酸脫氫酶濃度的測定值增高。血鈣、鎂、鉀、鈉濃度的測定值可能降低。氨基糖苷類與β內酰胺類混合時可導致相互失活，阿米卡星與上述抗生素聯合應用時必須分瓶滴注。阿米卡星亦不宜與其他藥物同瓶滴注應給予患者足夠的水分，以減少腎小管損害。阿米卡星與其他氨基糖苷類合用或先后連續局部或全身應用可增加耳毒性、腎毒性及神經肌肉阻滯作用，與神經肌肉阻斷藥合用。可加重神經肌肉阻滯作用導致肌肉軟弱、呼吸抑制等癥狀與卷曲霉素、順鉑、依他尼酸、呋塞米或萬古霉素等合用，或先后連續局部或全身應用。可能增加耳毒性與腎毒性與頭孢噻吩或頭孢唑林局部，或全身合用可能增加腎毒性。不宜與兩性霉素B頭孢噻吩磺胺嘧啶和四環素等注射劑配伍，不在同一瓶中滴注與多粘菌素類注射劑合用或先后連續局部或全身應用，可增加腎毒性和神經肌肉阻滯作用。其他腎毒性藥物及耳毒性藥物均不宜與阿米卡星合用或先后應用以免加重腎毒性或耳毒性。
