急性支氣管炎的患者對抗菌藥物并無明顯的治療效果，在治療急性支氣管炎患者時應避免濫用抗菌藥物，但如果患者出現發熱、咳膿性痰和重癥咳嗽，則為應用抗菌藥物的指征。對急性支氣管炎患者應用抗菌藥物治療，可以用針對肺炎支原體和肺炎衣原體的抗菌藥，如紅霉素，克拉霉素，阿奇霉素。
流行性感冒期間如有急性支氣管炎的表現，應該應用抗流感的措施，如給予奧司他韋等抗流感病毒的藥物。
慢性支氣管炎急性加重期：
第一，要控制感染，視感染的主要致病菌和嚴重程度，或者是根據病原菌的藥敏結果選用抗菌藥物。如患者有咳膿性痰，為應用抗菌藥物的指征，輕癥者可口服，較重者應該肌注或靜脈注射抗菌藥物，常用的有青霉素、紅霉素、氨基糖苷類、喹諾酮類和頭孢類抗生素。
第二，祛痰鎮咳。對急性發作期患者在抗感染治療的同時，應用祛痰及鎮咳藥，以改善癥狀，常用的藥物有氯化銨合劑、溴己新、氨溴索、乙酰半胱氨酸泡騰片等。中成止咳藥也有一定的效果，如蛤蚧定喘膠囊等。對年老體弱和咳痰無力者應避免利用鎮咳劑，以免抑制中樞，以及加重呼吸道阻塞和產生并發癥。
第三，解痙平喘。常用氨茶堿、特布他林等口服或用沙丁胺醇等短效支氣管舒張劑吸入。霧化療法，霧化療法可以稀釋氣管內的分泌物，有利于排痰，可以給予沐舒坦、普米克、慶大霉素、糜蛋白酶等霧化治療。
