避孕藥的不良反應有以下幾點：
第一，類早孕反應，在服藥的初期大約10%的婦女可以出現食欲缺乏，惡心，嘔吐，乏力，頭暈等類似妊娠早期的反應，不需特殊處理，堅持服藥周期后副作用會自然消失，如果癥狀比較嚴重可以更換其他的制劑或是停藥改用其他的避孕措施。
二，不規則陰道流血，在服藥期間陰道流血可以稱為突破性的出血，多數發生在漏服避孕藥以后，少數漏服避孕藥也可能會發生，點滴性出血不用處理，隨著服藥期的延長可以逐漸減少甚至停止。流血量比較多的，每天在服用必要同時可以加用雌激素直到停藥，流血似月經量或者是流血時間已經快達到會經月經期的時候可以停用服藥，作為下一次月經來潮，在下一個月經周期再開始服用藥物或是更換避孕藥。
三，閉經，大約1%到2%的婦女可以發生閉經，常見于月經不規則的婦女。
四，體重或皮膚的變化，早期研制的避孕藥中由于雄激素活性強，個別的婦女服藥后食欲亢進，體內合成代謝增加，體重增加，極少數的婦女可以出現面部的淡褐色的色素沉著，近年來隨著口服避孕藥不斷的發展，雄激素活性降低，孕激素的活性增強，用量比較小，副作用也明顯的降低，而且能夠明顯的改善皮膚的痤瘡。
五，其他的副作用，個別婦女服藥會出現頭痛，復視，乳房脹痛，可以給予對癥的處理，必要時可以給與停藥進一步的觀察。
