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大慶市第二醫院是黑龍江省規模最大、綜合實力較強的三級傳染病專科醫院。主要擔負大慶及我省西部地區肝炎、結核等三十余種傳染病診斷治療及突發公共衛生事件的醫療救治任務。
醫院與北京佑安醫院、解放軍302醫院、北京胸科醫院、北京地壇醫院、杭州師范大學附屬醫院、中國醫學科學院腫瘤醫院、哈爾濱醫科大學附屬第一醫院感染科建立了長期技術協作關系，是黑龍江中醫藥大學、大慶醫學高等專科學校的教學醫院，與黑龍江中醫藥大學聯合開辦了研究生課程進修班。醫院的綜合實力已位居東北三省傳染病院前列。
近年來，醫院選派肝病、結核病、腫瘤、外科業務骨干到名院拜名醫學專長，打破學科發展的人才瓶頸。學科帶頭人培訓率達到200%，現已有醫學及行政管理專業碩士、研究生34名、博士2名，副高職以上專業人員271人。近幾年醫院先后引進40余名腫瘤、兒科等專業碩士研究生及醫學影像、麻醉、腎病等醫院急需緊缺的技術骨干;開展科研30余項，其中26項獲省市科學技術進步獎。
醫院擁有64排CT、血液透析系統、數字減影血管造影系統、美國RITA射頻消融腫瘤治療系統等一批高端、現代化醫療設備。醫院成立了微創介入、無創肝纖維化、血液透析、臨床檢驗、內窺鏡等治療中心，并積極推進學科結構調整，腫瘤增科已獲省衛生廳批準，液基細胞學胸腹水腫瘤細胞病理檢查項目獨具特色和優勢;生物治療、檢驗、醫學影像、外科等腫瘤相關學科建設已具規模，為多學科聯合建設腫瘤治療中心打下了基礎。目前，腫瘤綜合靶向微創治療技術、中藥離子導入療法、血漿置換術治療重癥肝病等多項技術應用于臨床并填補省市空白，T-SPOR項目成為大慶地區結核病鑒別診斷的標志性項目，慢性肝病抗病毒療法等多項技術已達到國內先進水平。乙型肝炎抗病毒治療、肝炎母嬰阻斷、腫瘤微創介入、肝膽外科、小兒傳染病及并發癥治療等學科已形成了特色和優勢，肝炎、結核、檢驗、醫學影像等一批特色學科享譽省內。
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