第一，支持治療，骨髓增生異常綜合征患者有明顯貧血或者伴有心肺疾患時可以輸紅細胞，ra和ras常因反復輸血造成鐵負荷增加，可以去鐵治療。有出血和感染時可以輸入血小板和應用抗生素。
第二，分化誘導劑，骨髓增生異常綜合征患者惡性克隆的某些細胞仍保留分化潛能有些藥物能誘導瘤細胞的分化，目前常用的有1,25-雙羥維生素d3。
第三，聯合化療，就多數得骨髓增生異常綜合癥而言，常規的抗白血病治療無益，對化療的耐受性比較低，治療效果比較差，即使獲得了緩解，緩解期也短，如果病人年齡小于五十歲處于RA期臨床狀態比較好，可酌情使用常規化療。
第四，腎上腺糖皮質激素，約10%到15%的患者應用腎上腺皮質激素治療后，外周血細胞計數明顯上升，但要注意皮質激素帶來的易感染，血糖升高等副作用。
第五，干細胞移植，根據骨髓增生異常綜合征患者預后積分，同時結合患者的年齡、體能狀況、依從性進行綜合判定，低危組一般不推薦化療及造血干細胞移植，但年輕的第五組患者能耐受高強度治療者，有望產生更好的效果，高危組需要高強的治療，造血干細胞移植可能獲得比較好的效果。同時中西結合治療，中醫辯證施治，也可以改善患者的癥狀，提高機體抗病能力，有利于病人的康復。
